故事以主角的第一人称进行，“我”（浅沼晋太郎配音）是京都大学的一名三年级生，原本期待着有一个玫瑰色多姿多彩的大学生活，希望自己能交上飘逸黑长发的漂亮女朋友。然而事与愿违，主人公经历了一场失败的恋爱，身

樱花飞舞的3月25日，完成了一学期学业的午后。高二学生阿良良木历（神谷浩史配音）从优等生羽川翼（堀江由衣配音）那里听说了本町出现吸血鬼的传言。当晚，历在地铁站台见到了一个血淋林的女人。她四肢全无，痛苦

E.U.联盟和布里塔利亚帝国旷日持久的战争在皇历2010年发生转机，帝国派出压倒性的兵力突袭远东日。在很短的时间内，日本这个国家不复存在，从此作为“11区”写入历史。旧日本人民流往世界各地，饱受歧视，

革命历228年，E.U.联盟联军少校蕾拉·玛露卡尔（坂本真绫配音）和中尉阿基德（入野自由配音）在巴黎期间化险为夷，将企图绑架吉恩·史麦拉斯将军（石冢运升配音）的11区日本少年成濑幸也（松冈祯丞配音）、

2029年3月某日，某国大使馆遭到一群经大规模义体改造的武装分子的入侵，众多外国使节及其同侪眷属沦为人质，事态十万火急。草薙素子（坂本真绫配音）召集巴特（松田健一郎配音）、陀古萨（新垣樽助配音）等得力

这是一段攻壳机动队成立前夕鲜为人知而又影响深远的故事。2027年6月6日的一天，隶属陆军机密部队501机关的真室中佐（宫内敦士配音）在闹市街头被人杀害，此前他曾陷入军火买卖的贿赂丑闻不得脱身，他对死亡

漫画家泉本真治（山下智久饰）患上了逐渐失去了视力的病症，好不容易获得人气的连载漫画也不得不停载。孤独失去希望的真治想从阳台跳下，而这时，他被他的粉丝，耳朵听不见的相田响（新木优子饰）拯救。