大唐年间，金华县有狐妖作祟，中秋前接连有人被咬噬致死。大理寺丞狄仁杰途经金华，阴差阳错地卷入案子，他强行克制自己的心理阴影，抽丝剥茧，最终靠悲悯心揭开了流传了十五年的“狐妖迷案”……

武周年间，洛阳当红舞妓含冤被斩，化厉鬼索命连环杀人。流放在外的第一神探狄仁杰被武后特赦并委任为钦差调查此案，不料在返城途中遭人刺杀坠崖失忆，被来洛阳寻妻却无法入城的落魄商贾吕昭元所救。二人阴差阳错身份

并州发生鼠患，监狱坍塌，狄仁杰临危受命。大量村民因为鼠患而染病，被困城中。狄仁杰为了挽救全城百姓的性命，追查病源，然而随着调查的深入，原来鼠灾背后竟然还隐藏着一个巨大的阴谋。